Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZC2HC1AQ96GY0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZC2HC1AQ96GY0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 504.6 ms