Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMP4Q96G21 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
IMP4Q96G21 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IMP4Q96G21 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms