Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
PIK3IP1Q96FE7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PIK3IP1Q96FE7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms