Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ0

SGTB, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTBQ96EQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SGTBQ96EQ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SGTBQ96EQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms