Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM52Q96A61 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TRIM52Q96A61 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms