Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZDHHC14-209ENST00000523706 5146 ntTSL 213.91□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 KLF3-202ENST00000482150 517 ntTSL 213.91□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 THAP4-201ENST00000321679 581 ntTSL 213.88□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MYO1G-204ENST00000480503 5672 ntTSL 213.85□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.23e-11■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FAM60A-204ENST00000536836 1734 ntTSL 213.81□□□□□ -0.23e-11■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZNF292-207ENST00000496806 770 ntTSL 313.78□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 UBASH3B-202ENST00000525711 572 ntTSL 413.72□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 KDM2A-207ENST00000526258 5671 ntTSL 1 (best)13.72□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TACC3-209ENST00000484651 2715 ntTSL 213.68□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 USP36-222ENST00000592275 594 ntTSL 413.63□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 AKT2-207ENST00000416362 974 ntTSL 513.57□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SAR1A-203ENST00000373239 468 ntTSL 313.53□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 MYO1G-205ENST00000483585 3692 ntTSL 213.5□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SLC20A2-204ENST00000518660 763 ntTSL 313.45□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 ATP7B-210ENST00000634296 2328 ntTSL 513.41□□□□□ -0.262e-10■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 USP36-206ENST00000586896 696 ntTSL 513.37□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZFC3H1-212ENST00000552994 7597 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MLH1-214ENST00000457004 668 ntTSL 313.32□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MLH1-208ENST00000442249 558 ntTSL 413.32□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FAM133B-208ENST00000481407 2293 ntTSL 213.29□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.292e-10■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ACVR1-206ENST00000424669 550 ntTSL 413.18□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.313e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.313e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.323e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 CTDSP1-208ENST00000482272 984 ntTSL 213.05□□□□□ -0.323e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TMEM59-201ENST00000234831 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.333e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.343e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.343e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ATXN7L3B-201ENST00000519948 7604 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TMEM241-216ENST00000583048 588 ntTSL 412.89□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 DHX38-213ENST00000569952 638 ntTSL 212.59□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 THAP4-205ENST00000497486 567 ntTSL 512.58□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TACC3-210ENST00000485989 726 ntTSL 312.51□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FAM193A-207ENST00000512465 4663 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TMEM39B-208ENST00000487305 2087 ntTSL 212.49□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 AL356966.1-203ENST00000629479 912 ntTSL 512.48□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PIK3C3-210ENST00000589056 2074 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ARHGAP17-217ENST00000575447 559 ntTSL 212.43□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SYNE2-208ENST00000553289 5261 ntTSL 212.43□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RNF44-206ENST00000509404 372 ntTSL 212.4□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FLJ37035-202ENST00000423178 2600 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RPH3AL-206ENST00000570954 568 ntTSL 412.24□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 70.6
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