RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369838.5

SH3BGRL2-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL2, Length 4,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EHMT2Q96KQ7 1210 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
SH3BGRL2-201ENST00000369838 APLP2Q06481 763 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRIM41Q8WV44 630 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BGRL2-201ENST00000369838 UBTFP17480 764 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.58■□□□□ 0.56
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PCGF6Q9BYE7 350 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ABCC9O60706 1549 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.54
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.54
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
SH3BGRL2-201ENST00000369838 HRCP23327 699 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SH3BGRL2-201ENST00000369838 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ITGAEP38570 1179 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FBLN2P98095 1184 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BGRL2-201ENST00000369838 POLR3GLQ9BT43 218 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SCRIBQ14160 1630 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ARID3CA6NKF2 412 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SH3BGRL2-201ENST00000369838 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
SH3BGRL2-201ENST00000369838 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
SH3BGRL2-201ENST00000369838 P3H3Q8IVL6 736 aa17.59■□□□□ 0.41
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRIM52Q96A61 297 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NEFLP07196 543 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BCANQ96GW7 911 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NEUROD1Q13562 356 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ERICH6Q7L0X2 663 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP17.32■□□□□ 0.36
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NACADO15069 1562 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRL2-201ENST00000369838 WIZO95785 1651 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CHGAP10645 457 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SLC24A1O60721 1099 aa17.12■□□□□ 0.33
SH3BGRL2-201ENST00000369838 STAG3Q9UJ98 1225 aa17.09■□□□□ 0.33
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KCNH8Q96L42 1107 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRL2-201ENST00000369838 BCL11AQ9H165 835 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ABCC8Q09428 1581 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BGRL2-201ENST00000369838 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BGRL2-201ENST00000369838 CEP162Q5TB80 1403 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SOGA1O94964 1423 aa16.89■□□□□ 0.29
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TSPY4P0CV99 314 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TSPY10P0CW01 314 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.84■□□□□ 0.29
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PLEKHG5O94827 1062 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BGRL2-201ENST00000369838 NEFMP07197 916 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SMARCA4P51532 1647 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BGRL2-201ENST00000369838 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
SH3BGRL2-201ENST00000369838 EEA1Q15075 1411 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ANP32CO43423 234 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BGRL2-201ENST00000369838 SMARCA2P51531 1590 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BGRL2-201ENST00000369838 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
SH3BGRL2-201ENST00000369838 GOLGA3Q08378 1498 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SH3BGRL2-201ENST00000369838 ERCC6Q03468 1493 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BGRL2-201ENST00000369838 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BGRL2-201ENST00000369838 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.72■□□□□ 0.27
SH3BGRL2-201ENST00000369838 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BGRL2-201ENST00000369838 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.71■□□□□ 0.26
SH3BGRL2-201ENST00000369838 A0A0G2JS52 829 aa16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.7 ms