Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNPO1Q92973 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNPO1Q92973 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms