Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LCN9Q8WX39 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN9Q8WX39 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms