Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX29Q8TEQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX29Q8TEQ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms