Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEE9

SAP25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25Q8TEE9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP25Q8TEE9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP25Q8TEE9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms