Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRSK1Q8TDC3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRSK1Q8TDC3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms