Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGARPQ8TDB4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGARPQ8TDB4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms