Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFWD2Q8NHY2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFWD2Q8NHY2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms