Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL23Q8NBE8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL23Q8NBE8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL23Q8NBE8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL23Q8NBE8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms