Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf106Q8NAJ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf106Q8NAJ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf106Q8NAJ2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf106Q8NAJ2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf106Q8NAJ2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf106Q8NAJ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf106Q8NAJ2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf106Q8NAJ2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf106Q8NAJ2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf106Q8NAJ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms