Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMC1Q7Z7K0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMC1Q7Z7K0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms