Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC6Q7Z403 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMC6Q7Z403 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms