Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SV2AQ7L0J3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SV2AQ7L0J3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SV2AQ7L0J3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms