Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SND1Q7KZF4 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-11■■■■□ 23.1
SND1Q7KZF4 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-11■■■■□ 23.1
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SND1Q7KZF4 RETSAT-203ENST00000429806 2335 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.174e-9■■■■□ 23.1
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SND1Q7KZF4 SLC2A3-206ENST00000490763 943 ntTSL 25.33□□□□□ -1.568e-10■■■■□ 23
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SND1Q7KZF4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.538e-7■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.495e-6■■■■□ 23
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