Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VITQ6UXI7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VITQ6UXI7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VITQ6UXI7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms