Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNIP4Q6PIL6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP4Q6PIL6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms