Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.452e-7■■■■■ 50.2
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PRPF8Q6P2Q9 WDR27-209ENST00000486490 492 ntTSL 510.52□□□□□ -0.737e-17■■■■■ 50.2
PRPF8Q6P2Q9 SENP6-209ENST00000485497 941 ntTSL 4-1.08□□□□□ -2.583e-12■■■■■ 50.2
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PRPF8Q6P2Q9 BDH2-206ENST00000506521 550 ntTSL 34.79□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 49.5
PRPF8Q6P2Q9 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.772e-7■■■■■ 49.5
PRPF8Q6P2Q9 ABCA2-207ENST00000437791 697 ntTSL 516.39■□□□□ 0.218e-18■■■■■ 49.5
PRPF8Q6P2Q9 CDK1-205ENST00000475504 1720 ntTSL 25.89□□□□□ -1.472e-10■■■■■ 49.5
PRPF8Q6P2Q9 CDK1-207ENST00000519078 723 ntTSL 35.16□□□□□ -1.588e-9■■■■■ 49.5
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PRPF8Q6P2Q9 ZNF292-206ENST00000485016 596 ntTSL 32.08□□□□□ -2.088e-7■■■■■ 49.5
PRPF8Q6P2Q9 USP4-208ENST00000464168 601 ntTSL 419.88■□□□□ 0.775e-7■■■■■ 49.5
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PRPF8Q6P2Q9 EIF4G2-221ENST00000532082 1069 ntTSL 1 (best)9.77□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 49.4
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