Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM74A1Q5RGS3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM74A1Q5RGS3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms