Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP78Q5JTW2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEP78Q5JTW2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms