Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXO43Q4G163 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO43Q4G163 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO43Q4G163 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms