Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSR1Q2NL82 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSR1Q2NL82 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms