Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRED3Q2MJR0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRED3Q2MJR0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms