Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSPP1Q1MSJ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSPP1Q1MSJ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms