Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNAPC1Q16533 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNAPC1Q16533 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNAPC1Q16533 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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