Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC6Q16204 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC6Q16204 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC6Q16204 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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