Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SURF2Q15527 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SURF2Q15527 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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