Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NBR1Q14596 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBR1Q14596 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBR1Q14596 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms