Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM53BQ14153 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM53BQ14153 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms