Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA3CQ13748 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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