Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMAN2Q12907 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMAN2Q12907 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms