Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SSRP1Q08945 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SSRP1Q08945 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms