Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNG1Q06432 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG1Q06432 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms