Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ID3Q02535 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ID3Q02535 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ID3Q02535 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ID3Q02535 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ID3Q02535 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ID3Q02535 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ID3Q02535 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ID3Q02535 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ID3Q02535 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ID3Q02535 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ID3Q02535 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ID3Q02535 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ID3Q02535 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ID3Q02535 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ID3Q02535 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ID3Q02535 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ID3Q02535 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ID3Q02535 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ID3Q02535 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ID3Q02535 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ID3Q02535 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ID3Q02535 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ID3Q02535 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ID3Q02535 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ID3Q02535 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ID3Q02535 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ID3Q02535 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ID3Q02535 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ID3Q02535 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ID3Q02535 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ID3Q02535 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ID3Q02535 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ID3Q02535 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ID3Q02535 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ID3Q02535 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ID3Q02535 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ID3Q02535 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ID3Q02535 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ID3Q02535 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ID3Q02535 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ID3Q02535 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ID3Q02535 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ID3Q02535 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ID3Q02535 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ID3Q02535 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ID3Q02535 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ID3Q02535 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ID3Q02535 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ID3Q02535 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ID3Q02535 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ID3Q02535 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ID3Q02535 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ID3Q02535 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ID3Q02535 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ID3Q02535 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms