Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MRPS9P82933 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPS9P82933 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms