Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB4BP68371 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBB4BP68371 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB4BP68371 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms