Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME3P61289 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME3P61289 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME3P61289 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME3P61289 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME3P61289 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME3P61289 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME3P61289 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME3P61289 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME3P61289 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME3P61289 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME3P61289 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME3P61289 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME3P61289 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME3P61289 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME3P61289 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME3P61289 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME3P61289 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME3P61289 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME3P61289 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME3P61289 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME3P61289 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME3P61289 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME3P61289 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME3P61289 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME3P61289 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME3P61289 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME3P61289 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME3P61289 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME3P61289 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME3P61289 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME3P61289 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME3P61289 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME3P61289 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME3P61289 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME3P61289 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME3P61289 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME3P61289 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME3P61289 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME3P61289 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME3P61289 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME3P61289 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME3P61289 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME3P61289 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME3P61289 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME3P61289 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME3P61289 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME3P61289 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME3P61289 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME3P61289 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME3P61289 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME3P61289 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME3P61289 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME3P61289 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME3P61289 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME3P61289 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME3P61289 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME3P61289 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME3P61289 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME3P61289 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME3P61289 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME3P61289 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME3P61289 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME3P61289 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME3P61289 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME3P61289 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME3P61289 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME3P61289 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME3P61289 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME3P61289 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME3P61289 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME3P61289 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME3P61289 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME3P61289 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME3P61289 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME3P61289 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME3P61289 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME3P61289 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME3P61289 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME3P61289 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME3P61289 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME3P61289 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME3P61289 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME3P61289 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME3P61289 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME3P61289 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME3P61289 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME3P61289 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms