Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
JAM2P57087 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAM2P57087 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAM2P57087 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAM2P57087 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAM2P57087 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAM2P57087 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAM2P57087 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JAM2P57087 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAM2P57087 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAM2P57087 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAM2P57087 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAM2P57087 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JAM2P57087 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JAM2P57087 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JAM2P57087 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JAM2P57087 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JAM2P57087 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JAM2P57087 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JAM2P57087 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JAM2P57087 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JAM2P57087 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JAM2P57087 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JAM2P57087 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
JAM2P57087 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
JAM2P57087 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JAM2P57087 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
JAM2P57087 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JAM2P57087 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JAM2P57087 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JAM2P57087 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
JAM2P57087 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
JAM2P57087 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JAM2P57087 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JAM2P57087 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JAM2P57087 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JAM2P57087 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JAM2P57087 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JAM2P57087 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JAM2P57087 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JAM2P57087 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JAM2P57087 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JAM2P57087 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
JAM2P57087 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JAM2P57087 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JAM2P57087 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JAM2P57087 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
JAM2P57087 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
JAM2P57087 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
JAM2P57087 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
JAM2P57087 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
JAM2P57087 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
JAM2P57087 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
JAM2P57087 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
JAM2P57087 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JAM2P57087 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JAM2P57087 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JAM2P57087 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JAM2P57087 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms