Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D1P54289 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D1P54289 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms