Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATMP50440 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATMP50440 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATMP50440 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATMP50440 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATMP50440 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATMP50440 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATMP50440 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATMP50440 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATMP50440 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATMP50440 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GATMP50440 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATMP50440 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATMP50440 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATMP50440 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATMP50440 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GATMP50440 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATMP50440 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATMP50440 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATMP50440 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATMP50440 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATMP50440 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATMP50440 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATMP50440 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATMP50440 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATMP50440 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GATMP50440 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GATMP50440 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GATMP50440 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GATMP50440 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATMP50440 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATMP50440 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATMP50440 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATMP50440 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GATMP50440 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATMP50440 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATMP50440 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATMP50440 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATMP50440 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATMP50440 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATMP50440 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATMP50440 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATMP50440 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATMP50440 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATMP50440 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATMP50440 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATMP50440 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GATMP50440 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATMP50440 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATMP50440 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATMP50440 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATMP50440 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATMP50440 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATMP50440 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATMP50440 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATMP50440 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATMP50440 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATMP50440 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATMP50440 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GATMP50440 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GATMP50440 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GATMP50440 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GATMP50440 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GATMP50440 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GATMP50440 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATMP50440 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATMP50440 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATMP50440 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATMP50440 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATMP50440 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATMP50440 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATMP50440 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATMP50440 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATMP50440 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATMP50440 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATMP50440 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATMP50440 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GATMP50440 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATMP50440 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GATMP50440 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GATMP50440 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GATMP50440 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATMP50440 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATMP50440 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATMP50440 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATMP50440 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATMP50440 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATMP50440 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATMP50440 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATMP50440 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GATMP50440 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATMP50440 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATMP50440 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATMP50440 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATMP50440 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GATMP50440 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GATMP50440 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GATMP50440 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GATMP50440 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GATMP50440 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms