Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNI2P48788 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TNNI2P48788 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNI2P48788 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms