Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD4P46934 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD4P46934 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms