Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS9P46781 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS9P46781 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS9P46781 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS9P46781 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS9P46781 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS9P46781 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS9P46781 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS9P46781 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS9P46781 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS9P46781 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS9P46781 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS9P46781 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS9P46781 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS9P46781 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS9P46781 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS9P46781 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS9P46781 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS9P46781 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS9P46781 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS9P46781 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS9P46781 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS9P46781 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS9P46781 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS9P46781 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS9P46781 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS9P46781 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS9P46781 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS9P46781 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS9P46781 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS9P46781 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS9P46781 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS9P46781 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS9P46781 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS9P46781 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS9P46781 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS9P46781 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS9P46781 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS9P46781 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS9P46781 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS9P46781 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS9P46781 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS9P46781 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS9P46781 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS9P46781 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS9P46781 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS9P46781 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS9P46781 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS9P46781 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS9P46781 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS9P46781 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS9P46781 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS9P46781 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS9P46781 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS9P46781 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS9P46781 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS9P46781 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS9P46781 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS9P46781 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS9P46781 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS9P46781 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS9P46781 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS9P46781 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS9P46781 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS9P46781 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS9P46781 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS9P46781 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS9P46781 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS9P46781 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS9P46781 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS9P46781 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS9P46781 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS9P46781 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS9P46781 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS9P46781 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS9P46781 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS9P46781 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS9P46781 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS9P46781 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS9P46781 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS9P46781 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms