Protein–RNA interactions for Protein: P42127

ASIP, Agouti-signaling protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIPP42127 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIPP42127 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIPP42127 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIPP42127 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIPP42127 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIPP42127 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ASIPP42127 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ASIPP42127 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ASIPP42127 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ASIPP42127 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ASIPP42127 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ASIPP42127 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ASIPP42127 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms