Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX1P40424 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX1P40424 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX1P40424 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX1P40424 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX1P40424 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX1P40424 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX1P40424 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PBX1P40424 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX1P40424 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX1P40424 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX1P40424 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX1P40424 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX1P40424 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX1P40424 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX1P40424 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX1P40424 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX1P40424 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX1P40424 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PBX1P40424 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX1P40424 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX1P40424 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX1P40424 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX1P40424 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX1P40424 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX1P40424 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PBX1P40424 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX1P40424 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX1P40424 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX1P40424 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX1P40424 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX1P40424 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX1P40424 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX1P40424 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX1P40424 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PBX1P40424 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PBX1P40424 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PBX1P40424 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX1P40424 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX1P40424 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX1P40424 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX1P40424 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX1P40424 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PBX1P40424 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX1P40424 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX1P40424 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX1P40424 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX1P40424 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX1P40424 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX1P40424 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PBX1P40424 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX1P40424 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX1P40424 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX1P40424 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX1P40424 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX1P40424 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX1P40424 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PBX1P40424 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX1P40424 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX1P40424 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX1P40424 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX1P40424 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX1P40424 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX1P40424 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PBX1P40424 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PBX1P40424 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX1P40424 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX1P40424 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX1P40424 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX1P40424 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX1P40424 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX1P40424 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PBX1P40424 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PBX1P40424 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PBX1P40424 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PBX1P40424 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX1P40424 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX1P40424 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX1P40424 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX1P40424 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX1P40424 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX1P40424 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX1P40424 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX1P40424 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX1P40424 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX1P40424 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX1P40424 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PBX1P40424 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms